Ja nodokļa maksātājs veic gan apliekamus, gan neapliekamus darījumus, jaunais PVN likums sākotnēji prasa veikt atsevišķu uzskaiti priekšnodokļa atskaitīšanas vajadzībām. Proporcija piemērojama tikai tādos gadījumos, kad atsevišķa uzskaite nav iespējama.

Likums paredz gadījumus, kad jāveic priekšnodokļa korekcijas. Turpmāk priekšnodoklis būs jākoriģē arī par nozagtām vai stihiskā nelaimē bojā gājušām precēm, ja vien dokumentāri nebūs pierādīts zādzības vai īpašuma iznīcināšanas fakts.

Ar jaunā PVN likuma spēkā stāšanos ir atcelts aizliegums atskaitīt priekšnodokli par iegādātām dienesta automašīnām un ar tām saistītiem izdevumiem tiem nodokļa maksātājiem, kuru apliekamo darījumu īpatsvars nesasniedz 50% no kopējo darījumu apmēra. Bez tam, iepriekš neatskaitīto priekšnodokli būs iespējas atskaitīt līdz 2013.gada 30.jūnijam.